인체질병의 연구를 위해서는 인체의 게놈 정보뿐 아니라 마이크로비옴 정보도 맞춤형 의료에서의 질환규명 및 관리를 위해 필요하며, 보건학적 측면에서도 영양관리와 질환관리 등에 대한 포괄적 정보를 규명하고 제공하는 중심연구센터로써 역할을 수행하고 있다. 차세대 서열분석 기술, 미생물 다양성 관리 및 확보 기술, 대용량 자료 분석을 위한 생물정보학 기술 등 보건학, 생물학, 의학, 통계학, 컴퓨터공학 등 여러 분야에서 새로운 기술들이 발달하는 과정에서, 마이크로비옴의 중요성과 관련 연구가 활기를 띠는 만큼, 마이크로비옴연구는 그 동안 알지 못했던 새로운 지식을 창출할 뿐 아니라, 이를 규명하기 위한 새로운 분석 기술을 개발하는 데에도 중요한 자원이 되고 있다. 마이크로비옴연구 센터는 마이크로비옴과 보건관련 기초 및 응용 연구성과 확보를 우선 목표로 하며, 각종 국가차원의 연구센터로써의 기능, 추후 연구자원과 성과가 축적되고 센터 운영의 노하우가 정비되면, 참여연구자들 간의 협의를 통해 보건, 의학 및 생명과학 관련 다학제 교육 프로그램 및 산학협력 프로그램도 개발하여 교육센터로서의 기능, 한국인 마이크로비옴 DB 등을 통한 정보를 제공하고 관련 파이프라인 및 분석 솔루션을 제공하는 정보센터로서의 기능을 하게 될 것이다.